上世纪90年代初，中国河南省部分中医药专家就开始了HIV/AIDS临床治疗的探索，后来又在坦桑尼亚和赞比亚开展了中医药防治艾滋病的临床研究，积累了大量的临床一线资料。2002年河南中医学院第一附属医院在全国高校率先成立了艾滋病研究所，2006年河南中医学院第一附属医院成立了艾滋病临床研究中心，同年河南省中医药防治艾滋病临床研究中心在该院成立，全面负责中国河南省中医药防治艾滋病的临床治疗和科学研究工作。
   经过4年多的建设，目前该院是国家中医临床研究基地（艾滋病）建设单位，拥有国家中医药管理局中医传染病学重点学科、国家中医药管理局重点研究室（艾滋病扶正排毒）和国家中医药管理局艾滋病检测三级科学研究实验室，建立了艾滋病临床科研门诊和病区。凝练了艾滋病病因病机与证候演变、中医药对无症状HIV感染期早期干预、中医药减轻HAART毒副作用、中医药降低HAART耐药率以及中医药治疗艾滋病的临床疗效评价等稳定的研究方向，围绕研究方向承担和参与承担了“艾滋病中医病因及发病机制的研究” （国家973计划）、“传染病临床治疗技术平台—中医药防治艾滋病临床科研能力建设”（十一五国家科技重大专项）、“中医药对艾滋病机会性感染和HAART毒副作用的研究”（十一五国家科技重大专项）、“扶正排毒片对无症状HIV感染者血浆免疫激活分子水平的影响”（国家自然科学基金）、“临床科研一体化技术平台体系构建及应用研究”（十一五国家科技重大专项）等11项国家级课题。已完成省部级科研课题10项，“中医药治疗艾滋病的基础理论与临床证治规律研究”和“河南省中医药治疗艾滋病管理模式与实施体系的研究”获得河南省中医药科技进步一等奖。